Manajemen inti merupakan bidang-bidang yang saling terkait dalam pengelolaan administrasi di Puskesmas Kragan 1 yang meliputi 

a. Ketatausahaan

    1) Ketatausahaan Puskesmas Kragan 1 merupakan kegiatan administrasi yang terkait    dengan pelaksanaan manajemen   puskesmas 

    2) Ketatausahaan Puskesmas Kragan 1 dilakukan menggunakan sistem informasi yang  terarah dengan Dinas Kesehatan Kabupaten Rembang sebagai induk kedinasan 

b. Kepegawaian 

1)    Bidang kepegawaian terkait dengan pengadaan, pemberhentian, dan sistem informasi kepegawaian

2)   Bidang kepegawaian juga terkait dengan mutasi, kepangkatan, dan promosi

3) Bidang kepegawaian juga terkait dengan pengembangan aparatur yang mengacu pada Kepegawaian Daerah

c.       Keuangan

Keuangan puskesmas adalah pengelolaan dana yang didapatkan dari Bantuan Operasional Kesehatan (BOK) dan Badan Layanan Umum Daerah (BLUD),  Sedangkan pengelolaan keuangan puskesmas meliputi :

1) Perencanaan

2) Pengorganisasian

3) Pengarahan

4) Pengendalian

5) Pengadaan dan pemanfaatan dana

6) Pencatatan data

7) Pelaporan

8) Pertanggung jawaban dana

Manajemen sumber daya merupakan proses pengelolaan sumber daya untuk mencapai tujuan tertentu di Puskesmas Kragan 1 manajemen sumberdaya meliputi sumber daya manusia, saranan dan prasarana, obat bahan medis habis pakai (BMHP)