Manajemen inti merupakan bidang-bidang yang saling terkait dalam pengelolaan administrasi di Puskesmas Kragan 1 yang meliputi
Ketatausahaan, Kepegawaian, dan Keuangan
a. Ketatausahaan
1) Ketatausahaan Puskesmas Kragan 1 merupakan kegiatan administrasi yang terkait dengan pelaksanaan manajemen puskesmas
2) Ketatausahaan Puskesmas Kragan 1 dilakukan menggunakan sistem informasi yang terarah dengan Dinas Kesehatan Kabupaten Rembang sebagai induk kedinasan
b. Kepegawaian
1) Bidang kepegawaian terkait dengan pengadaan, pemberhentian, dan sistem informasi kepegawaian
2) Bidang kepegawaian juga terkait dengan mutasi, kepangkatan, dan promosi
3) Bidang kepegawaian juga terkait dengan pengembangan aparatur yang mengacu pada Kepegawaian Daerah
c. Keuangan
Keuangan puskesmas adalah pengelolaan dana yang didapatkan dari Bantuan Operasional Kesehatan (BOK) dan Badan Layanan Umum Daerah (BLUD), Sedangkan pengelolaan keuangan puskesmas meliputi :
1) Perencanaan
2) Pengorganisasian
3) Pengarahan
4) Pengendalian
5) Pengadaan dan pemanfaatan dana
6) Pencatatan data
7) Pelaporan
8) Pertanggung jawaban dana
Manajemen Sumber Daya (SDM,Sarpras, Obat dan BMHP)
Manajemen sumber daya merupakan proses pengelolaan sumber daya untuk mencapai tujuan tertentu di Puskesmas Kragan 1 manajemen sumberdaya meliputi sumber daya manusia, saranan dan prasarana, obat bahan medis habis pakai (BMHP)
Manajemen Aset (Bangunan, Prasarana, dan Peralatan)
Manajemen puskesmas